Покровский монастырь был основан в 1635 году, изначально он был мужским. В 1870 году, по благословению святителя Иннокентия, митрополита Московского, обители был присвоен статус миссионерского. В стенах монастыря действовал первый в России Миссионерский институт, который за 9 лет подготовил и направил в сибирские епархии десятки миссионеров. Монастырь служил гостиницей для лиц, приезжавших в Москву по миссионерским делам. Он также задумывался и как место покоя (богадельня) для заслуженных миссионеров. Здесь планировалось разместить библиотеку и архив Православного Миссионерского общества, созданного святителем Иннокентием. К сожалению, со смертью святителя в 1879 году многие его начинания так и не получили продолжения. Однако до революции монастырь продолжал принимать в своих стенах миссионеров, для чего в 1893 году было построено отдельное здание гостиницы.
После закрытия монастыря в 1929 году в зданиях размещались различные организации, в бывшей гостинице – магазины, а на верхних этажах ОБХСС (отдел по борьбе с хищениями социалистической собственности).
К концу 1980-х годов здание гостиницы настолько обветшало, что его даже не стали ремонтировать, а предпочли снести.
Весь фундамент здания перед заливкой бетоном был посыпан лепесточками, освященными на мощах святой праведной блаженной Матронушки Московской.
Святейший Патриарх Московский и всея Руси Кирилл во время посещения Покровской обители внимательно знакомился с ходом строительных работ.
За два года здание было полностью возведено, еще около года продолжались внутренние отделочные работы. И наконец, к великой радости паломников, 23 июля 2015 года состоялось освящение и открытие воссозданной монастырской гостиницы. Символическую ленточку разрезали Святейший Патриарх Московский и всея Руси КИРИЛЛ, игумения монастыря игумения Феофания и председатель Попечительского совета комплексной целевой программы «Духовно-нравственная культура подрастающего поколения России» С.В. Медведева.